% BIF7104 — Bioinformatique et sciences de la santé % UQAM — Département d'informatique % Plan de cours — Hiver 2021 * Horaires, locaux et enseignants: Responsable(s) du cours ======================= Coordination ------------ Makarenkov, Vladimir PK-4815 Enseignement ------------- Calderon, Virginie PK-4115 Groupes: 010 Description du cours ==================== Ce cours vise à introduire les récentes technologies bioinformatiques d'analyse du génome humain pour appuyer les sciences de la santé. Les approches de type NGS (Next-Generation Sequencing) seront largement abordées en théorie et en pratique. Préalables académiques : Études d'associations pangénomiques. Corrélations des SNPs, des haplotypes et des cartes génomiques avec des maladies. Introduction aux modèles et ressources bioinformatiques pour la génétique des populations (modèle, déséquilibre de liaison, coalescence). Méthodes d'analyse des interactions hôte-parasite, ARNs et protéines viraux. Méthodes et ressources pour l'analyse des voies métaboliques. Méthodes d'analyse du criblage à haut débit. Ressources et algorithmes en pharmaco-génomique. Algorithmes d'analyse de la structure de la chromatine et les associations aux modifications épigénétiques. Génomique et thérapeutique personnalisées. Objectif du cours ================= A la fin de la session, l'étudiant devra avoir une bonne connaissance de la méthodologie appliquée à l'analyse de données génomiques ainsi que les concepts abordée en cours, et être capable de rechercher des outils adéquats. Formule Pédagogique =================== Certains des cours donnés seront divisés entre une présentation théorique et une pratique. Modalités d'évaluation ====================== Un projet de session qui sera évalué en 4 parties (résumé, suivi, présentation, rapport) Une revue thématique par binôme : présentation, participation aux questions 1 controle terminal Renseignement utiles ====================